Okazaki fragments: fragmentos
de Okazaki.
Pequeños fragmentos de ADN sintetizados sobre la hebra retrasada
del ADN. Tienen una longitud variable entre 1000 y 2000 nucleótidos
(en bacterias) y entre 100 y 400 nucleótidos (en los organismos
eucariotas). Véase DNA replication.
oligonucleotide : oligonucleótido.
Polímero de nucleótidos unidos por enlaces 5-3 fosfodiéster
de muy breve longitud. Por lo general no supera los 50 nucleótidos.
Véase polynucleotide.
Observación: en la jerga de laboratorio, se conocen más
comúnmente con el nombre de «oligos». Incluso es
posible que hasta se escriban así.
omics: ómicas.
Forma abreviada
de referirse coloquialmente a diversas esferas emergentes de la biología molecular dedicadas al estudio de todos los componentes de una
determinada clase dentro de un sistema biológico dado, con ayuda de herramientas
automatizadas de análisis a gran escala. Por ejemplo: genomics (genómica,
estudio cuantitativo de la totalidad de genes y secuencias reguladoras y no codificantes
contenidas en el genoma), transcriptomics (transcriptómica, estudio
de la población total de ARN transcritos), proteomics (proteinómica
o proteómica, estudio de todas las proteínas sintetizadas y de sus
posibles modificaciones postraduccionales), metabolomics (metabolómica,
estudio del complemento de metabolitos de bajo peso molecular), glycomics
(glucómica, estudio de todos los hidratos de carbono), pharmacogenomics (farmacogenómica,
estudio cuantitativo de la forma en que el genotipo afecta a la respuesta del
individuo a un determinado fármaco). (La lista anterior no es exhaustiva.)
Observación: según Günter Kahl (catedrático
de Plant Molecular Biology en la Universidad Johann Wolfgang Goethe, en Frankfurt
[Alemania], y autor de The Dictionary of Gene Technology), el término fue acuñado
por John N. Weinstein (Head, Genomics & Bioinformatics Group del National
Cancer Institute, Bethesda, Maryland [EE. UU.]).
open complex: complejo abierto.
En la transcripción, es la asociación de la ARN-polimerasa
con la doble hélice semiabierta del promotor de un gen. En este
complejo, las hebras de ADN están separadas a lo largo de un trecho
de 14 pb alrededor del nucleótido que marca el inicio de la transcripción
y se dibujan con forma de burbuja.
open reading frame (ORF) : marco
de lectura abierto.
Marco de lectura compuesto únicamente de tripletes no solapados
y que codifica un polipéptido. Incluye un codón de iniciación
de la traducción en el extremo 5 y un codón de finalización
de la traducción en el extremo 3. Véase reading
frame.
Observación: a diferencia de la inglesa ORF, las siglas
españolas correspondientes apenas se utilizan.
operator: operador.
Secuencia de ADN específica a la que se une un represor. Véase
repressor.
operon: operón.
Unidad génica de los organismos procariotas formada por un conjunto
de genes que desempeñan funciones metabólicas relacionadas
y que se expresan de forma coordinada y regulada.
Observación: el ejemplo típico es el operón lac de E.
coli, que codifica las diversas enzimas responsables del metabolismo
de la lactosa. Consta, de izquierda a derecha (de 5 a 3),
de la secuencia de unión del activador (CAP, de Catabolite
Activator Protein, también conocido con el nombre de CRP,
de cAMP Receptor Protein), de un promotor superpuesto parcialmente
a un operador (sitio de unión del represor Lac), que precede
a los genes lac Z (de la enzima betagalactosidasa), lac Y (de
la enzima lactosa-permeasa) y lac A (de la enzima tiogalactósido-transacetilasa).
A partir del promotor se transcriben estos tres genes en un mismo ARNm
policistrónico, cuya transcripción es estimulada por
el activador en ausencia de glucosa o es reprimida por el represor
en ausencia de lactosa. Es decir, los genes lac de E. coli sólo
se expresan de forma eficiente en presencia de lactosa y ausencia de
glucosa a la vez.
ordered clone sequencing: secuenciación
jerárquica.
→ hierarchical sequencing
ornithine decarboxylase antizyme: antizima
de la ornitina-descarboxilasa.
antizyme
ORF : ORF.
open
reading frame.
orthologous genes: genes ortólogos.
→ orthologs
orthologs: ortólogos.
Genes pertenecientes a especies biológicas distintas derivados de un gen
ancestral común por un fenómeno de especiación y no de duplicación.
Normalmente los ortólogos conservan la misma función en las líneas
descendientes del mismo ancestro. Un ejemplo clásico de genes ortólogos
son los que codifican las cadenas α de la hemoglobina humana y murina.
overlap hybridization: desplazamiento
sobre el cromosoma.
→ chromosome walking.